Genética y evolución en la pandemia de COVID-19

Fernando González Cadenas

doi:10.18002/ambioc.i19.7331

Autores

Fernando González Cadenas

DOI:

https://doi.org/10.18002/ambioc.i19.7331

Palavras-chave:

Escape vacunal, Selección natural, Transmisión, Variantes, Vigilancia genómica

Resumo

La pandemia ocasionada por el coronavirus SARS-CoV-2 ha alterado la vida, la economía, las relaciones sociales y personales en nuestro planeta y, desgraciadamente, ha producido más de 5 millones de muertes (datos a noviembre de 2021). Por otra parte, ha puesto de manifiesto el papel esencial que tiene la investigación biomédica y lo dependiente que es nuestra sociedad de muchos trabajos científicos que solían pasar inadvertidos. Además de mostrar el poder que se deriva de la acción coordinada y cooperativa de grupos de investigación, la pandemia también ha puesto un foco en disciplinas que, en gran medida, han sido ignoradas hasta el momento. La aparición de variantes de preocupación e interés y su relación con los incrementos en la incidencia de las infecciones en diferentes olas o la posibilidad de que representen escapes vacunales ha llevado a la OMS a establecer la vigilancia genómica como una de las herramientas fundamentales para conocer y controlar la expansión del virus. En este artículo, vamos a analizar algunos aspectos fundamentales de la evolución y genética de las poblaciones del
virus y cómo nos pueden ayudar a interpretar adecuadamente los datos derivados de los análisis de secuencias completas del genoma viral, método ideal para
realizar dicha vigilancia.

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Referências

Blount, Z.D., Barrick, J.E., Davidson, C.J. y Lenski, R.E. 2012. Genomic analysis of a key innovation in an experimental Escherichia coli population. Nature, 489:513–518.

Boni, M.F., Lemey, P., Jiang, X., Lam, T.T.-Y., Perry, B.W. et al. 2020. Evolutionary origins of the SARS-CoV-2 sarbecovirus lineage responsible for the COVID-19 pandemic. Nat Microbiol, 5:1408–1417.

Delaune, D., Hull, V., Karlsson, E., Hassanin, A., Ou, T.P. et al. 2021. A novel SARSCoV-2 related coronavirus in bats from Cambodia. Nat Commun, 12:1–7.

Duchêne, S., Featherstone, L., Haritopoulou-Sinanidou, M., Rambaut, A. et al. 2020. Temporal signal and the phylodynamic threshold of SARS-CoV-2. Virus Evol, 6:veaa061.

Gutierrez, B., Castelan, H., da Cilva, C., Jackson, B., Fleishon, S. et al. 2021. Emergence and widespread circulation of a recombinant SARS-CoV-2 lineage in North America. medRxiv, 2021.11.19.21266601.

Hodcroft, E.B., Zuber, M., …, González-Candelas, F., Stadler, T., Neher, R.A., 2020. Spread of a SARS-CoV-2 variant through Europe in the summer of 2020. Nature, 595:707–712.

Jackson, B., Boni, M.F., Bull, M.J., Colleran, A., Colquhoun, R.M. et al. 2021. Generation and transmission of inter-lineage recombinants in the SARS-CoV-2 pandemic. Cell, 184:5179–5188.

Khadka, B. y Gupta, R. 2021. Conserved molecular signatures in the spike protein provide evidence indicating the origin of SARS-CoV-2 and a Pangolin-CoV (MP789) by recombination(s) between specific lineages of Sarbecoviruses. PeerJ, 9:e12434.

Korber, B. Fischer, W.M., Gnanakaran, S., Yoon, H., Theiler, J. et al. 2020. Tracking changes in SARS-CoV-2 spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 virus. Cell, 182:812–827.

López, M., Chiner-Oms, A., García de Viedma, D., Ruiz-Rodriguez, P., Bracho, M.A., …, González-Candelas, F., Comas, I. 2021. The first wave of the COVID-19 epidemic in Spain was associated with early introductions and fast spread of a dominating genetic variant. Nat Genet, 153:1405–1414.

Ohta, T. 1973. Slightly deleterious mutant substitutions in evolution. Nature, 246:96–98.

Wu, F., Zhao, S., Yu, B., Chen, Y.-M., Wang, W. et al. 2020. A new coronavirus associated with human respiratory disease in China. Nature, 579:265–269.